Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r39G3UWE6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r39G3UWE6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r39G3UWE6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms