Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Susd5G3UW60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd5G3UW60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd5G3UW60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms