Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20517G3UVU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20517G3UVU6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms