Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp9yF8VPU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms