Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21970F6XX07 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21970F6XX07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms