Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Igkv1-99F6XWB2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Igkv1-99F6XWB2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms