Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9887F6RFI0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms