Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Raph1F2Z3U3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms