Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms