Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col22a1E9Q7P1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col22a1E9Q7P1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col22a1E9Q7P1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col22a1E9Q7P1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms