Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Susd1E9Q3H4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd1E9Q3H4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms