Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5430401F13RikE9Q328 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430401F13RikE9Q328 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5430401F13RikE9Q328 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms