Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt90E9Q1Z0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms