Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3250E9Q1M3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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