Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx60E9PZQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddx60E9PZQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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