Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl3lE9PWZ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl3lE9PWZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl3lE9PWZ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms