Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
4930407I10RikD3Z5T8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930407I10RikD3Z5T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
4930407I10RikD3Z5T8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
4930407I10RikD3Z5T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms