Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc78D3Z5T1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms