Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm4871D3Z0W7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm4871D3Z0W7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm4871D3Z0W7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms