Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc8D3YZV8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms