Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd1D3YXK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms