Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cspp1B2RX88 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cspp1B2RX88 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms