Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah3B2RWG3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah3B2RWG3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms