Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5483B2RV77 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5483B2RV77 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms