Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zscan5bB2RTN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zscan5bB2RTN3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zscan5bB2RTN3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms