Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trabd2bB1ATG9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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