Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spocd1B1ASB6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spocd1B1ASB6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms