Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al2bA9Z055 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms