Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prss40A6H6T1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prss40A6H6T1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms