Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp8b5A3FIN4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.2 ms