Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Upf2A2AT37 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Upf2A2AT37 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Upf2A2AT37 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms