Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll9A2APC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms