Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4985A2ALC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4985A2ALC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4985A2ALC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms