Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sec16aA2AIX1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec16aA2AIX1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms