Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc163A2AGD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc163A2AGD7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms