Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd4A2AFR3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms