Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd5A2A8L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd5A2A8L1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms