Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Akap17bA2A3V1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Akap17bA2A3V1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms