Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trav12-2A0N8N6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trav12-2A0N8N6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms