Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc112A0AUP1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc112A0AUP1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms