Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmpd3A0A140LIW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms