Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms