Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms