Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms