Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cdh20Q9Z0M3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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