Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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