Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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