Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf3a3Q9D554 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sf3a3Q9D554 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms