Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms