Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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